MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia afzelii PKo clone fragment c

Total Repeats: 232

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_167352	A	7	7	118	124	100 %	0 %	0 %	0 %	294679246
2	NT_167352	CT	3	6	183	188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NT_167352	A	6	6	205	210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_167352	ACT	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679247
5	NT_167352	TAA	2	6	301	306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679247
6	NT_167352	ATT	2	6	309	314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679247
7	NT_167352	TTAC	2	8	321	328	25 %	50 %	0 %	25 %	294679247
8	NT_167352	AAT	3	9	342	350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679247
9	NT_167352	T	7	7	371	377	0 %	100 %	0 %	0 %	294679247
10	NT_167352	T	6	6	492	497	0 %	100 %	0 %	0 %	294679247
11	NT_167352	ATCT	2	8	503	510	25 %	50 %	0 %	25 %	294679247
12	NT_167352	ATA	2	6	620	625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679247
13	NT_167352	TTC	2	6	692	697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NT_167352	ATTT	2	8	732	739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_167352	ACTCAA	2	12	813	824	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NT_167352	A	6	6	843	848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_167352	AAT	2	6	852	857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_167352	T	6	6	868	873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_167352	ATTT	2	8	947	954	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_167352	TTTTA	2	10	969	978	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_167352	A	7	7	1017	1023	100 %	0 %	0 %	0 %	294679248
22	NT_167352	TAT	2	6	1121	1126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_167352	A	6	6	1142	1147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_167352	TAT	3	9	1200	1208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_167352	GTA	2	6	1214	1219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NT_167352	AAT	2	6	1243	1248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NT_167352	T	7	7	1368	1374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_167352	AAT	2	6	1391	1396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_167352	CTTT	2	8	1560	1567	0 %	75 %	0 %	25 %	294679249
30	NT_167352	GCTTT	2	10	1629	1638	0 %	60 %	20 %	20 %	294679249
31	NT_167352	A	6	6	1649	1654	100 %	0 %	0 %	0 %	294679249
32	NT_167352	ATC	2	6	1682	1687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679249
33	NT_167352	TAT	2	6	1744	1749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679249
34	NT_167352	AAT	2	6	1758	1763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679249
35	NT_167352	T	7	7	1813	1819	0 %	100 %	0 %	0 %	294679249
36	NT_167352	TA	3	6	1827	1832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_167352	T	8	8	1843	1850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_167352	A	6	6	1863	1868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_167352	TAT	2	6	1912	1917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_167352	CTT	2	6	1918	1923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NT_167352	GAA	2	6	1931	1936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NT_167352	ATTA	2	8	1937	1944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_167352	AAT	3	9	1945	1953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_167352	TAT	2	6	1960	1965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_167352	CTTT	2	8	1995	2002	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NT_167352	T	7	7	2037	2043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_167352	ATA	2	6	2044	2049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_167352	T	7	7	2052	2058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NT_167352	TTC	2	6	2068	2073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NT_167352	T	7	7	2094	2100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_167352	TTAT	2	8	2103	2110	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_167352	T	6	6	2132	2137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NT_167352	T	9	9	2146	2154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_167352	TTA	2	6	2171	2176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_167352	T	6	6	2180	2185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_167352	A	6	6	2186	2191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_167352	TA	3	6	2213	2218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_167352	TTA	2	6	2219	2224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_167352	CTA	2	6	2307	2312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NT_167352	AAAC	2	8	2313	2320	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NT_167352	TTACA	2	10	2371	2380	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NT_167352	A	6	6	2398	2403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_167352	TTGTT	2	10	2404	2413	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NT_167352	ATTTT	2	10	2486	2495	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NT_167352	ATTA	2	8	2509	2516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_167352	ATT	2	6	2527	2532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NT_167352	TAAT	2	8	2539	2546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_167352	A	6	6	2547	2552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_167352	AT	3	6	2557	2562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_167352	A	6	6	2604	2609	100 %	0 %	0 %	0 %	294679250
71	NT_167352	TAT	2	6	2612	2617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679250
72	NT_167352	TAATT	2	10	2618	2627	40 %	60 %	0 %	0 %	294679250
73	NT_167352	TAT	2	6	2635	2640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679250
74	NT_167352	TTC	2	6	2642	2647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679250
75	NT_167352	T	6	6	2656	2661	0 %	100 %	0 %	0 %	294679250
76	NT_167352	TAAAG	2	10	2696	2705	60 %	20 %	20 %	0 %	294679250
77	NT_167352	TAC	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679250
78	NT_167352	AGA	2	6	2783	2788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
79	NT_167352	TAG	2	6	2792	2797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679250
80	NT_167352	TAA	2	6	2819	2824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679250
81	NT_167352	AGA	2	6	2853	2858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
82	NT_167352	A	6	6	2868	2873	100 %	0 %	0 %	0 %	294679250
83	NT_167352	CTC	2	6	2880	2885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294679250
84	NT_167352	AAT	2	6	2922	2927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679250
85	NT_167352	A	7	7	2942	2948	100 %	0 %	0 %	0 %	294679250
86	NT_167352	ATA	2	6	2980	2985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679250
87	NT_167352	AT	4	8	2988	2995	50 %	50 %	0 %	0 %	294679250
88	NT_167352	A	6	6	3015	3020	100 %	0 %	0 %	0 %	294679250
89	NT_167352	A	6	6	3029	3034	100 %	0 %	0 %	0 %	294679250
90	NT_167352	A	6	6	3039	3044	100 %	0 %	0 %	0 %	294679250
91	NT_167352	ATT	2	6	3047	3052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679250
92	NT_167352	GAG	3	9	3070	3078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294679250
93	NT_167352	AGA	2	6	3137	3142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
94	NT_167352	AGA	2	6	3158	3163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
95	NT_167352	GAA	2	6	3174	3179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
96	NT_167352	GAA	2	6	3183	3188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
97	NT_167352	AGA	3	9	3191	3199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
98	NT_167352	AT	3	6	3236	3241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NT_167352	CTAG	2	8	3262	3269	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NT_167352	AAT	2	6	3279	3284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_167352	ATTGA	2	10	3306	3315	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NT_167352	A	6	6	3326	3331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_167352	AAG	2	6	3336	3341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NT_167352	TAT	2	6	3347	3352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NT_167352	TAA	2	6	3357	3362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_167352	CTA	2	6	3414	3419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NT_167352	GAA	2	6	3420	3425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NT_167352	TAT	2	6	3431	3436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NT_167352	A	7	7	3437	3443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NT_167352	AT	3	6	3449	3454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NT_167352	ATTTT	2	10	3461	3470	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NT_167352	T	6	6	3520	3525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NT_167352	AT	3	6	3536	3541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NT_167352	AAG	2	6	3552	3557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NT_167352	T	6	6	3595	3600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NT_167352	AT	3	6	3615	3620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NT_167352	A	6	6	3624	3629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NT_167352	C	10	10	3653	3662	0 %	0 %	0 %	100 %	294679251
119	NT_167352	T	9	9	3692	3700	0 %	100 %	0 %	0 %	294679251
120	NT_167352	T	6	6	3734	3739	0 %	100 %	0 %	0 %	294679251
121	NT_167352	T	8	8	3758	3765	0 %	100 %	0 %	0 %	294679251
122	NT_167352	T	7	7	3769	3775	0 %	100 %	0 %	0 %	294679251
123	NT_167352	TAAAT	2	10	3785	3794	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NT_167352	ATA	2	6	3797	3802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NT_167352	TTCT	2	8	3819	3826	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NT_167352	TA	3	6	3887	3892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NT_167352	T	7	7	3899	3905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NT_167352	TAT	2	6	3919	3924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NT_167352	T	6	6	3929	3934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NT_167352	AAAGA	2	10	4001	4010	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NT_167352	A	8	8	4015	4022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NT_167352	TTA	2	6	4037	4042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NT_167352	AGCCTT	2	12	4058	4069	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NT_167352	TTTG	2	8	4075	4082	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NT_167352	GTA	2	6	4120	4125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NT_167352	TTC	2	6	4128	4133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NT_167352	CTT	2	6	4143	4148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NT_167352	T	7	7	4167	4173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NT_167352	T	8	8	4182	4189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NT_167352	TTA	2	6	4255	4260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679252
141	NT_167352	TAT	2	6	4263	4268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679252
142	NT_167352	TTATT	2	10	4292	4301	20 %	80 %	0 %	0 %	294679252
143	NT_167352	TAG	2	6	4313	4318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679252
144	NT_167352	GTTTA	2	10	4410	4419	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NT_167352	TAA	2	6	4491	4496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NT_167352	T	6	6	4501	4506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NT_167352	ATT	2	6	4537	4542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NT_167352	AAAG	2	8	4557	4564	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NT_167352	TTA	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NT_167352	TA	4	8	4586	4593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NT_167352	TA	3	6	4596	4601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NT_167352	TAAT	2	8	4683	4690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NT_167352	TAAA	2	8	4704	4711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NT_167352	CTT	2	6	4723	4728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NT_167352	TAAA	2	8	4821	4828	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NT_167352	ATT	2	6	4846	4851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NT_167352	TTTA	2	8	4885	4892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NT_167352	A	6	6	5463	5468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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231	NT_167352	ATTTC	2	10	6796	6805	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.